Ученые показали ВИЧ на видео‍

Американские исследователи сняли ВИЧ на видео. Биологи показали специальную компьютерную симуляцию, фиксирующую взаимодействие внешней белковой оболочки молекулы вируса иммунодефицита и окружающей его среды. Запись представлена на портале Иллинойсского университета в Урбане-Шампейне.



На видео ряде можно заметить синие и желтые частицы, которые входят в капсид и покидают его. Отрицательно заряженные ионы, как продемонстрировала модель, скапливаются на внутренней поверхности внутри белковой оболочки, в то время как ионы с положительным зарядом располагаются на наружных участках. Последние становятся причиной притяжения отрицательных нуклеотидов, которые включают ДНК клетки, в которую происходит внедрение ВИЧ.

При некотором значении отличия потенциалов не исключается вероятность разрыва стенок капсида. Такая уязвимость ВИЧ может быть использована в целях ведения профилактики и лечения от ВИЧ. Построенная компьютерная модель включает 64 млн атомов. Необычная симуляция создавалась с применением методик молекулярной динамики. Требуемые расчеты вели на протяжении 2-х лет с использованием суперкомпьютеров Blue Waters и Titan.
Автор: Валерий Антонов